J Comput Biol: Nowa metoda przewidywania celu leków przeciwwirusowych lub szczepionek

Nowa metoda przewidywania najbardziej obiecujących leków przeciwwirusowych lub celów szczepionkowych opiera się na zmianach konformacyjnych doświadczanych przez glikoproteiny wirusowe podczas rozpoznawania i wiązania z komórkami gospodarza. Ta metoda przewidywania jest skierowana do głównego łańcucha wiązania wodorowego o najwyższym motywie wolnej energii. Podobne wyniki badań są publikowane w Journal of Computational Biology, który jest recenzowanym czasopiśmie opublikowanym przez Mary Ann Liebert.

Robert Penner jest przewodniczącym Rene Thom francuskiego Instytutu Szkolnictwa Wyższego (Bures-sur-Yvette) i Biologii Matematycznej UCLA. Jest autorem tego artykułu zatytułowanego "Backbone Free Energy Estimator stosowane do glikoprotein wirusowych"

Źródło obrazu: Mary Ann Liebert, Inc., wydawcy

Gdy wirus wchodzi do komórki gospodarza i jest wchłaniany, wirus zwykle przechodzi energiczną rekombinację, tworząc motyw fuzji / infiltracji. Penner zaproponował ogólną metodę przewidywania wysoce aktywnych konformatycznie pozostałości z trójwymiarowej struktury glikoprotein wirusowych. Metoda obejmuje analizę wiązań wodorowych białka i obliczanie wolnych różnic energetycznych odpowiednich cech w celu określenia obszarów, w których zmiana konformacyjna jest najbardziej prawdopodobna. Metoda proponowana w tym dokumencie jest obecnie stosowana do glikoproteiny skokowej SARS CoV-2, która może powodować COVID-19.

Misha Gromov z Institute of Advanced Science and New York University powiedziała: "Matematyczna idea bezpośrednio prowadzi do praktycznego znaczenia, które jest po prostu cudem, ale nagroda jest ogromna, ponieważ występuje w teorii pola elektromagnetycznego Maxwella- przynosi radio i telewizję , Otwierając drzwi do teoretycznych obliczeń w naszym cyfrowym świecie. " Jest znanym matematykiem i laureatem Nagrody Abla (znanej również jako Nagroda Nobla w dziedzinie matematyki). "Tylko wtedy, gdy jego autor jest wybitnym matematykiem, ale ma również szeroki horyzont naukowy, taki pomysł jest możliwy, a to jest rzadkością wśród najlepszych matematyków naszych czasów. Robert Penner jest tak rzadkim matematykiem, odkrył, że metoda struktury białka różni się od innych na świecie, a wzór struktury białka jest wynikiem czystego myślenia matematycznego. Metoda ta może odgrywać rolę i przyspieszyć rozwój leków antywirusowych lub szczepionek. Ale tylko eksperymenty mogą to udowodnić. "(Bioon.com)

Źródła: